●1999年5月29日，国务院发布了第266号令，颁布《饲料和饲料添加剂管理条例》，饲料管理从此走上法制化道路。
●1999年8月18日，农业部、对外贸易经济合作部联合发出《关于加强对进口饲用油脂和动物性饲料经营和使用管理的通知》，禁止在我国境内生产。经营、使用来自“疯牛病”、“痒病”疫病国家和地区的饲用油脂、动物性饲料及其产品，并公布了禁止经营和使用的原产于欧盟的饲用油脂和动物性饲料税号目录。
●2000年12月1日，国家发展计划委员会批准农业部报送的饲料安全工程项目。项目建设期为2000～2004年。项目主要建设内容包括：改扩建1个国家级饲料监测中心，12个部级饲料监测中心，24个省级饲料监测所，2个饲料标准与饲料安全评价基地，l个饲料产品质量监测预报网络中心网站。项目总投资初步匡算为1.945亿元，饲料安全工程项目正式启动。
●2000年12月30日，农业部、对外贸易经济合作部和国家出入境检验检疫局联合发出了《关于加强肉骨粉等动物性饲料产品管理的通知》，要求各级畜牧、饲料科贸管理部门和各直属检验检疫局加强对肉骨粉等动物性饲料产品的管理，防止使用禁用的动物性饲料产品。从2001年1月1日起，禁止从欧盟国家进口动物性饲料产品。
●2001年1月22日，温家宝同志在农业部《关于浙江省违禁药品残留畜产品中毒事件处理情况的报告》上批示：确保饲料安全是关系食品安全和群众利益的一件大事。要加大对违禁药品查处的力度。所需经费请财政部予以支持。
●2001年3月12日，国内35家大中型饲料企业率先在全国发起了《饲料安全新世纪宣言》，向社会公开承诺，不制假、不售假，绝不在饲料产品中使用违禁添加物，确保饲料产品安全，在社会上引起了强烈反响。
●2001年7月12日，财政部、国家税务总局联合发出通知，自2001年8月1日起，继续对饲料产品免征增值税。免征增值税饲料产品范围包括：单一大宗饲料、混合饲料、配合饲料、复合预混料和浓缩饲料。
●2001年11月29日，国务院发布了第327号令，公布《国务院关于修改＜饲料和饲料添加剂管理条例＞的决定》，这标志着我国饲料法制化管理又提高到一个新的历史水平。新条例增设了知识产权保护制度、饲料和饲料添加剂使用管理制度、饲料添加剂安全使用规范制度，进一步制定和完善了法律责任制度。
●2002年8月16日，最高人民法院、最高人民检察院《关于办理非法生产、销售、使用禁止在饲料和动物饮用水中使用的药品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》公布施行，为依法查处“瘦肉精”等违禁药品行为提供了法律依据。
●2003年9月5日，国务院办公厅转发了农业部关于促进饲料业持续健康发展若干意见，明确了当前和今后一个时期饲料生产和安全监管的目标，制定了促进饲料业持续健康发展的政策措施。
●2003年4月7日，农业部发布《关于修改＜饲料添加剂和添加剂预混合饲料生产许可证管理办法＞的决定》。修改后的办法于2003年6月1日起施行，明确了农业部饲料添加剂和添加剂预混合饲料生产许可证专家审核委员会的法定地位，进一步规范了申证程序，增强了企业申证过程的可执行性；增加了生产许可证的注销和吊销两种处罚，进一步加强了对饲料企业的监管力度。
●2003年7月23日，农业部和国家质量监督检验检疫总局联合发布第287号公告，对进口饲料级混合油（含作饲料用的使用过的混合植物油）的进口登记、分装容器标准和进口报检等问题予以明确。公告要求各级饲料管理部门和各出人境检验检疫机构要密切配合，加强对进口饲料级混合油的监管。
●2003年8月26日，全国饲料工作办公室会同农业部产业政策与法规司，就广州市翠竹饲料添加剂厂生产含有“瘦肉精”的猪用预混合饲料一案举行了公开听证会。这是《行政处罚法》实施以来，农业部组织的第一次行政处罚听证会。这次听证会不仅依法确认了广州市翠竹饲料添加剂厂的违法事实，有力地震慑了不法分子，宣传了《饲料和饲料添加剂管理条例》等法规，同时展示了饲料行政执法人员良好的依法行政风采。
●2003年12月9日，农业部发布第318号公告，公布了《饲料添加剂品种目录》。该目录包括允许在中国境内生产、经营和使用的饲料添加剂品种191种，保护期内的新饲料添加剂品种9种。原《允许使用的饲料添加剂品种目录》（农业部公告第105号）同时废止。
●2003年12月5日～26日，农业部组织元旦、春节期间北京等五城市生猪中“瘦肉精”突击抽查。共抽查待宰生猪尿样909批次，检出含有“瘦肉情”尿样10批次，检出率下降1.1％，比2002年同期突击抽查“瘦肉精”检出率下降4.3个百分点。严厉打击了在生猪生产中使用“瘦肉精”的违法行为，保证元旦、春节期间畜产品和水产品安全。
